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這篇Nature Chemistry,像極了愛情!
納米技術 2020-04-27

導讀:限域作用在自然界中廣泛存在,其特別突出的特點是能夠在溫和條件中進行反應,考慮到目前催化反應中大部分需要苛刻的反應條件,從大自然中尋找答案是不二選擇。事實上,在限域催化里限域主體與限域客體之間具有十分奇妙的關系。一方面,限域主體能給客體提供相對不受干擾的反應環境,另一方面,兩者之間形成的獨特相互作用則可能提高相應反應的速率及選擇性。


從某種角度來說,這何嘗不是一種陪伴、一種守候、一種保護,又何嘗不是一種相互影響、不離不棄、矢志不渝。這樣看來,限域催化是不是像極了愛情?


最近,Nature Chemistry和Nature Nanotechnology(綜述)先后上線了針對材料限域作用的文章。下文對此做出了詳細解讀,供讀者品鑒其奧妙之處。

 

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第一作者:Hiroki Takezawa

通訊作者:Hiroki TakezawaMakoto Fujita

通訊單位:東京大學

 

研究亮點:

1. 反應物分子和MOF形成化學計量比的復合結構。

2. 反應物在MOF的孔中官能團發生扭曲,實現了預活化,能實現溫和條件反應。

 

研究背景

酰胺有機分子官能團的旋轉能壘較高、具有較高的化學惰性,這是因為官能團中N原子上的孤對電子和羰基π*反鍵軌道之間的強共軛作用導致的。通過改變平面結構破壞這種共軛效應,酰胺分子的物理/化學性質得以改變。但是通過外力作用扭轉分子中的平面結構非常困難,通過蛋白質折疊的酰胺扭曲作用是實現溫和氣氛中蛋白剪切、水解的關鍵過程。

 

當酰胺分子發生扭曲時,酰胺分子中N原子上的孤對電子和羰基官能團的π*軌道發生扭曲,因此更容易和親核試劑進行反應,目前有少量關于合成扭曲的酰胺分子,但是從機理出發活化酰胺進行反應的研究并沒有很多。

 

擬解決或者擬探索的關鍵問題

通過限域作用實現改善酰胺水解反應活化能。

 

成果簡介

有鑒于此,東京大學的Takezawa, H.Fujita, M.等報道了在自組裝的籠中扭曲結構穩定的酰胺分子,通過將二級酰胺分子引入Td結構的籠中,結果顯示順式扭曲的酰胺分子比反式扭曲的酰胺分子更容易形成,通過單晶X射線衍射方法得以驗證(扭曲角度達到34°),通過扭曲作用,酰胺水解反應速率得以提高


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 1. 文獻示意圖

 

要點1:研究出發點和基礎

使用Td結構的疏水多孔材料,該籠結構之前報道有以下反應活性:將兩個線性分子正交排列,鉻染料(chromic dye)的打開/閉合轉移(open/closed equilibrium shift),擁擠的烯烴的亞穩態扭曲構象(a metastable twisted conformation of an overcrowded alkene)。籠材料上的三氮雜苯配體和π客體分子之間構造了V型三明治結構區域,反式芳基酰胺分子進入籠材料會轉變為順式結構分子,并形成準S4立體結構二聚體構建Td立體結構。

 

要點2:酰胺和MOF的復合結構的生成

20 mM籠材料(Pd金屬和三氮雜苯有機配體組成的MOF)(1a)和5倍量的酰胺分子(2a)分散在D2O溶液中,并在100 ℃中加熱1 h,除去未反應的酰胺分子,使用1H NMR方法得到反應的酰胺為25 %,并形成1a·(2a)2結構。反應后,溶液的顏色由淡黃色變為橘紅色,說明籠和酰胺之間的電荷轉移作用。

 

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2. 反應設計scheme

 

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 3. MOF的合成示意圖

 

要點3:限域分子結構表征

1H NMR結果顯示,籠的立體結構由Td轉變為C1,同時酰胺分子以C1立體結構形成二聚體。對不同的酰胺和籠之間的作用進行表征,結果顯示籠對酰胺有選擇性:富電子的酰胺更容易結合到籠中,這是由于籠具有缺電子特征,富電子酰胺和籠有更好的相互作用 

 

X射線表征分子結構。通過單晶X射線衍射方法對籠中的2a分子結構進行表征,分析顯示籠中有兩種C2立體結構酰胺分子,并且兩種C2立體結構分子構成C1二聚結構。酰胺產生了C-N-C-C之間的34°,30°二面角,這種π-π堆疊結構之間的電荷轉移是體系顏色變化的原因。

 

NMR表征。π-π堆疊導致2b酰胺分子的氫原子酸性變化,順式酰胺分子、反式酰胺分子的芳基氫化學位移為5.4~3.5 ppm8.2~5.6 ppm2c酰胺分子同樣以順式/反式(1:1)比例與籠形成1a·(2c)2結構。與之不同,2d酰胺分子以1a·2d形成復合物,并且2d分子以反式結構負載在籠中。

 

總之,通過調控酰胺的結構,發現能以不同立體結構結合到MOF的籠中,酰胺分子的電子結構(富電子)是與本文中MOF(缺電子型)結合的條件。調控酰胺取代基的組成和結構,能夠調控分子在MOF籠中的結構。

 

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4. 酰胺和MOF結合scheme 

 

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5. 限域扭曲酰胺結構表征 

 

要點4:酰胺水解反應

限域酰胺的水解反應。將限域有酰胺分子的復合結構在100 mM NaOHD2O中于60 ℃中進行水解反應,生成對應的酸和胺。對比反應結果顯示,限域在籠中的產物的反應速率得以大幅度改善,水解反應有3~14倍速率的提高。

 

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6. 限域扭曲酰胺在堿性體系中的水解反應

 

要點5:前期重要工作

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 7. Science 2006, 312, 251. DOI:10.1126/science.1124985

 

小結

限域作用在自然界合成中普遍存在,是實現溫和條件合成的最關鍵的因素,限域作用最主要的作用是降低反應活化能,和調控反應的發生進程。人工合成中使用限域作用能夠顯著改善反應選擇性反應條件。

 

參考文獻

Takezawa, H., et al. Enhanced reactivity of twisted amides inside a molecular cage,Nat. Chem. 2020,

DOI:10.1038/s41557-020-0455-y

https://www.nature.com/articles/s41557-020-0455-y

 

作者簡介:

Makoto Fujita(藤田誠),于1987年在東京工業大學獲得工學博士學位,于1988年在千葉大學就職,1999年在名古屋大學獲得教授職位,2002年來到東京大學執教至今。Fujita是和MOF執牛耳者Omar Yaghi比肩的金屬有機材料大師,于2018年獲得“諾貝爾獎風向標”之譽的“沃爾夫獎Wolf Prize)”的化學獎。是世界上領先開發自組裝化型超分子絡合物,以及由此產生的獨立空間的熱點化學研究,可以說該領域世界第一人。Fujita教授側重于用金屬和有機配體構造大孔的離散結構,以及使用金屬有機框架(MOF)結構吸附天然產物并解析其結構,開發了大孔超分子籠(Cage)和結晶海綿(Crystal Sponge,也稱“晶體海綿”)

主頁: http://fujitalab.t.u-tokyo.ac.jp/home_e/

 

Nature Nanotechnology綜述:限域作用體系和作用

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第一作者:Angela B. Grommet

通訊作者:Rafal Klajn

通訊單位:以色列威茲曼科學研究所

 

限域分子的物理和化學性質會發生改變,限域作用在生命的起源中扮演重要作用,生命過程能在溫和條件中持續的進行復雜生物活性反應,以色列魏茨曼科學研究所Rafal Klajn發現人工限域作用中同樣能夠展現這種高反應活性,并對這種人工體系中的合成限域反應作用進行總結。

 

本文要點:

1)對納米限制效應影響合成系統化學反應性的方式進行了分類。在納米限域下,可以通過調節化學性質來提高反應速率、提高選擇性和穩定反應物質。納米限域效應實現方法:組裝到納米空間、孔道、口袋、通道中;將分子局限在二維材料表面上。具有限域作用的體系包括:化合物體系-穴狀配體,分子盒,柱狀芳烴,葫蘆科,空泡蛋白和半胡蘿卜素;自組裝體系-配位籠,氫鍵環境,蛋白質。COF、MOF體系具有整體均一的孔結構,囊泡和膠束、雙層脂質、納米聚合物體系展現出不規則性

 

限域作用有效的改善了催化反應活性(反應速率、對映體選擇性):提高孔區域或界面區域反應物的濃度、外界刺激響應的反應器(通過外界刺激,反應物會富集在特定區域內,并改善了反應速率)、提升催化劑的濃度或將催化劑限制在區域內、改善催化劑和反應物之間的相互作用穩定性(有時,催化劑和反應物能同時組裝到限域范圍內,并因此具有更強的相互作用;催化劑和反應物同樣可以同時在界面上富集,實現提高催化反應活性)。類似于生物酶的催化作用,限域作用的催化反應動力學過程遵循Michaelis-Menten動力學過程,遵照該機理,產物的脫除過程是決速步驟。限域作用會對產物的選擇性起到調節作用(產物的大小、結構),此外對籠內部進行修飾構建手性空間,能夠實現對映選擇性反應過程。此外,限域的中間體物種會得以穩定,并無法過度反應,防止大量副反應產物。

 

2)限域效應也會導致物理性質的變化。發光體的熒光、染料的顏色可以在限制條件下調節。發光過程中的電子給體-受體之間的相互作用同樣受到和催化反應類似的作用,其中弱相互作用(π-π堆疊、范德瓦爾斯力)明顯改變,抑制了分子的轉動過程(分子轉動是導致量子產率降低的重要因素),并降低了分子之間的相互作用(阻止了分子聚集導致的熒光淬滅作用)。

 

3)限域作用能在不改變限域分子結構的情況中調節電化學性能。當分子限域到和電有相互作用的體系中,分子的還原電極電勢會改變,并且限域材料能夠和分子之間實現電荷傳遞作用,當這種作用形成長程作用時,會實現電荷轉移作用的導電能力。在限域作用中,分子之間會產生獨特的電相互作用,并且當分子之間能夠相互接觸時,這種作用更加顯著。這種電相互作用在C60分子體系中研究較深入。此外,TCNQ(7,7,8,8-四氰基喹二甲烷)通過氰基和MOF中的金屬結合實現電相互作用,結果顯示材料導電性提高了6個數量級。

 

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參考文獻

Angela B. Grommet, et al. Chemical reactivity under nanoconfinement Nat. Nanotechnol. 15, 256–271 (2020).

DOI:10.1038/s41565-020-0652-2

https://www.nature.com/articles/s41565-020-0652-2

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