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Nature:保護好T細胞,抗腫瘤更持久!
小奇 奇物論 2024-05-23
髓樣細胞是腫瘤微環(huán)境 (TME) 中最豐富的免疫細胞,人們對治療靶向它們的抗腫瘤作用非常感興趣。TAM密度的增加與某些癌癥臨床結(jié)果的改善相關(guān),通過阻斷 CD47-SIRPα 軸增強 TAM 吞噬活性介導(dǎo)幾種臨床前模型中的抗腫瘤作用。CD47-SIRPα軸阻斷劑的臨床試驗表明,當與其他藥物聯(lián)合使用時,在某些液體腫瘤中具有抗腫瘤活性,但缺乏單藥活性或在實體癌中的臨床證據(jù)。因此,盡管付出了廣泛的努力,但缺乏針對 TAM 以獲得臨床益處的治療方法。過繼轉(zhuǎn)移的T細胞和旨在阻斷CD47-SIRPα軸的藥物是有前途的癌癥療法,可以激活免疫系統(tǒng)的不同分支。但抗CD47 抗體與過繼轉(zhuǎn)移的 T 細胞聯(lián)合使用,由于巨噬細胞介導(dǎo)的了 CAR-T 細胞的快速清除,并未觀察到明顯的治療益處。


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(Crystal L Mackall 醫(yī)學(xué)博士是斯坦福癌細胞治療中心的創(chuàng)始主任、斯坦福癌癥研究所副所長和癌癥免疫治療項目負責(zé)人。2022年被評為美國癌癥研究協(xié)會院士與美國國家醫(yī)學(xué)院院士。她的工作主要才基礎(chǔ)免疫學(xué)出發(fā),主要關(guān)注兒童癌癥。她領(lǐng)導(dǎo)了許多首次人體和兒童臨床試驗,涵蓋樹突狀細胞疫苗、細胞因子以及使用 NK 細胞和轉(zhuǎn)基因 T 細胞的過繼免疫療法。)

近日,美國斯坦福大學(xué)斯坦福癌癥研究所癌細胞治療中心的Crystal L Mackall院士團隊報道了一種工程化CD47表達CAR-T細胞療法。這種 CD47 變體 CD47(Q31P)(47E)與 SIRPα 結(jié)合并提供“不要吃我”信號,該信號不會被抗 CD47 抗體阻斷。表達 47E 的 TCR 或 CAR T 細胞在用抗CD47 抗體治療后對巨噬細胞清除具有抵抗力,并介導(dǎo)大量、持續(xù)的巨噬細胞募集到腫瘤微環(huán)境。盡管許多募集的巨噬細胞表現(xiàn)出 M2 樣特征,但聯(lián)合治療協(xié)同仍增強了抗腫瘤療效。巨噬細胞被確定為 T 細胞持續(xù)性的主要調(diào)節(jié)因子,并指明將 T 細胞定向療法與巨噬細胞激活療法相結(jié)合的根本挑戰(zhàn)。工程化 CD47 提供了一種能夠同時利用 T 細胞和巨噬細胞的抗腫瘤作用的治療方法,增強了對實體瘤的殺傷效力。

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抗 CD47 消除 CAR T 和 TCR T 細胞療效:
為了驗證通過 CD47 阻斷增強巨噬細胞吞噬作用可以提高 CAR T 細胞療法療效的假設(shè),將 HER2-BBζ CAR T 細胞和/或抗 CD47 單克隆抗體 B6H12對 143B 骨肉瘤荷瘤小鼠進行治療。單獨使用CAR T細胞誘導(dǎo)抗腫瘤作用,但添加抗CD47抗體消除CAR T細胞功效。為了研究雙重治療治療失敗的原因,定量B7H3-BBζ CAR T 細胞 ± B6H12 治療后荷瘤小鼠的人 T 細胞。B7H3-BBζ CAR T細胞加B6H12治療小鼠的腫瘤和血液中完全不存在人T細胞,但僅用CAR T細胞治療的小鼠中存在。抗CD47抗體可誘導(dǎo)過繼轉(zhuǎn)移的T細胞快速耗竭,包括那些被設(shè)計為表達轉(zhuǎn)基因TCR或具有不同靶向和共刺激結(jié)構(gòu)域的CAR細胞。

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圖1 抗CD47抗體通過巨噬細胞介導(dǎo)的T細胞耗竭消除過繼轉(zhuǎn)移的T細胞功效

CD47 對 CAR T 細胞的存續(xù)至關(guān)重要:
確定 T 細胞消融是否通過 FcR 介導(dǎo)的抗體依賴性吞噬作用發(fā)生,使用CV-1,一種與 CD47 結(jié)合但不與FcR 結(jié)合的融合蛋白。與 B6H12 的結(jié)果類似,CV-1 消除了 CD19 CAR T 細胞對Nalm6-fLuc小鼠的抗腫瘤功效,并誘導(dǎo)接近完全 T 細胞耗竭。使用 CRISPR-Cas9 敲除 CD47 來測試過繼轉(zhuǎn)移 T 細胞的存活是否需要 CD47 表達。47WT型CAR T 細胞在 Nalm6-fLuc 小鼠中擴增并介導(dǎo)了強大的腫瘤控制并顯著延長了生存期,而47KO CAR T細胞耗盡,沒有抗腫瘤活性。(CD47 的過表達)47OE 與體內(nèi)對照組相比,CD19-28ζ CAR T 細胞介導(dǎo)的長期抗腫瘤療效明顯更好,T 細胞存續(xù)更好。總而言之,過繼轉(zhuǎn)移 T 細胞的存活需要 CD47 表達和SIRPα 參與,并且 CD47 過表達增強了 CAR T 細胞的持久性和療效,即使在沒有 CD47 阻斷劑和沒有免疫排斥的情況下也是如此。

驗證巨噬細胞在介導(dǎo)抗CD47誘導(dǎo)的T細胞耗竭中的作用。在 B6H12 給藥之前,進行巨噬細胞耗盡,發(fā)現(xiàn)巨噬細胞耗竭小鼠的 CAR T 細胞數(shù)量顯著升高,即使在沒有 CD47 阻斷的情況下也是如此。巨噬細胞確定為過繼轉(zhuǎn)移的 T 細胞植入和抗腫瘤功效的障礙。進一步解釋了將抗CD47與過繼性T細胞療法相結(jié)合是徒勞的,并暗示巨噬細胞介導(dǎo)的吞噬作用是T細胞在體內(nèi)存續(xù)的重要調(diào)節(jié)因子。

人巨噬細胞吞噬細胞T細胞:
研究原代人巨噬細胞在體外吞噬原代人T細胞的潛力。轉(zhuǎn)導(dǎo)表達CAR的T細胞被吞噬水平明顯高于正常T細胞,且B6H12給藥進一步增加吞噬水平。巨噬細胞吞噬作用受“吃我”信號的平衡調(diào)節(jié),例如鈣網(wǎng)蛋白7,以及“不要吃我”信號,例如 CD47。CD47在CD4和CD8 T細胞之間以及T細胞分化狀態(tài)間的表達相對均勻,但CD47在培養(yǎng)物中的表達隨時間推移而降低,而鈣網(wǎng)蛋白表達在同一時期增加。這解釋了老化的CAR T細胞更容易受到吞噬作用。

從接受商業(yè) CD19-28ζ CAR T 細胞治療的患者身上收集的腦脊液 (CSF) 的常規(guī)細胞學(xué)分析顯示,組織細胞吞噬淋巴細胞,與巨噬細胞介導(dǎo)的吞噬作用一致。為了更系統(tǒng)地解決這種可能性,分析了從最近兩項 axi-cel 臨床研究中收集的單細胞 RNA 測序 (scRNA-seq) 數(shù)據(jù)。兩個數(shù)據(jù)集都證明了骨髓細胞中存在CAR mRNA,與巨噬細胞介導(dǎo)的人類CAR T細胞吞噬作用一致。這些數(shù)據(jù)提供了進一步的證據(jù)來支持骨髓細胞吞噬CAR T細胞,因此可能限制過繼轉(zhuǎn)移細胞的持久植入或活化T細胞在臨床環(huán)境中的存活。

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圖2 巨噬細胞吞噬CAR T細胞在體外和患者體內(nèi)

抗CD47可以起到安全開關(guān)的作用:
基于上述研究,抗CD47介導(dǎo)的T細胞耗竭可以作為一種現(xiàn)成的安全開關(guān)來減輕CAR T細胞的毒性。為了測試這一點,使用一種多特異性整合素結(jié)合肽(PIP)CAR,靶向在多種惡性腫瘤中表達的整合素16。PIP CAR T細胞在體外介導(dǎo)了有效的活性,但用PIP CAR T細胞治療的載骨肉瘤小鼠表現(xiàn)出急性毒性。即使在非荷瘤小鼠中,用PIP-28ζ CAR T細胞治療也很快導(dǎo)致毒性。相比之下,聯(lián)合B6H12 的 PIP-28ζ CAR T 細胞治療沒有表現(xiàn)出任何明顯的毒性或體重減輕,包括血液中沒有檢測到的人類細胞因子。

在異種移植模型中,CAR T 細胞存續(xù)延長可導(dǎo)致移植物抗宿主病 (GvHD)。為了確定抗 CD47 治療是否可以持續(xù)預(yù)防 GvHD,監(jiān)測用 CD19-BBζ CAR T 細胞治療的 Nalm6 小鼠。48 天后,觀察到用CD19-BBζ CAR T 細胞治療的小鼠出現(xiàn) GvHD,表現(xiàn)為脫發(fā)和體重減輕,而用 CAR T 細胞聯(lián)合 B6H12 治療的小鼠沒有發(fā)生 GvHD。這些數(shù)據(jù)表明,CD47阻斷有望作為消除CAR-T細胞相關(guān)毒性的現(xiàn)成安全開關(guān),嚴格的急性毒性模型和慢性CAR T細胞毒性模型的挽救證明了這一點。

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圖3 抗CD47療法可用作安全開關(guān)

工程 CD47 不與抗 CD47 結(jié)合:
為了通過 CD47 阻斷誘導(dǎo)選擇性腫瘤吞噬作用,同時保護 T 細胞免受吞噬作用,作者團隊試圖設(shè)計一種 CD47 變體,該變體可拒絕抗 CD47 結(jié)合但保留 SIRPα 相互作用。使用FACS對酵母顯示的 CD47 突變變體庫進行六次連續(xù)分選,在針對 B6H12 的陰性分選和針對 CV-1 的陽性。最終分類中的所有變體都包含單個A30P(CD47(A30P))或Q31P(CD47(Q31P))點突變。當在酵母上顯示為具有游離CD47 N末端的單個CD47變體時,表現(xiàn)出不與 B6H12 的結(jié)合,但保留了與 CV-1 和 SIRPα 正常或增強的結(jié)合。CD47的BC環(huán)突變,特別是Ala30和Gln31,產(chǎn)生的蛋白質(zhì)保留SIRPα結(jié)合,但免于與多種抗CD47單克隆抗體結(jié)合,為設(shè)計“不要吃我”信號CD47變體的能力提供了概念證明。這些變體不會被抗CD47單克隆抗體阻斷, 這將驅(qū)動腫瘤特異性吞噬作用,同時保留 TME 中的 T 細胞。

接下來,測量人類供體巨噬細胞對47KO Jurkat細胞的吞噬作用,這些細胞被改造為表達CD47WT、CD47(A30P)或CD47(Q31P)。在多個供體中,在B6H12與任一變體孵育后,巨噬細胞介導(dǎo)的吞噬作用顯著降低,但與CD47(Q31P)相比,CD47(A30P)提供的保護較少,CD47(Q31P)完全阻止了B6H12孵育后的額外吞噬作用。基于這一結(jié)論,繼續(xù)研究CD47(Q31P)即47E(工程化CD47)。

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圖4 CD47 的工程變體保留與 SIRPα 的結(jié)合,但不再與抗 CD47 抗體結(jié)合

CAR T細胞將巨噬細胞募集到腫瘤中:
將CFSE 標記的 HER2-BBζ CAR T 細胞被瘤內(nèi)注射到原位腫瘤中,腫瘤樣本顯示巨噬細胞浸潤明顯,而B6H12治療后CAR T細胞減少和CFSE巨噬細胞增加的趨勢。接下來用47WT或47HER2-BBζCAR T細胞處理143B荷瘤小鼠,B6H12不影響47E-CAR T細胞受體中的TME巨噬細胞水平,但顯著降低了47WT-CAR T中的巨噬細胞水平。通過scRNA-seq分析證實,CAR T細胞和巨噬細胞腫瘤浸潤高度相關(guān),這與CAR T淋巴細胞將巨噬細胞募集到腫瘤中的模型一致,并且巨噬細胞的募集取決于CAR T在腫瘤中的存續(xù)。

47WT和47CAR T細胞scRNA-seq圖譜顯示T細胞表達顯著表達TNF、IFNG、CCL3、CCL4、CCL5、CSF1和CSF2,它們共同吸引和激活單核細胞和巨噬細胞,并與T細胞介導(dǎo)的巨噬細胞募集到腫瘤中有關(guān)。在接受或不接受B6H12治療的情況下,47E CAR T細胞治療的基因表達基本上沒有變化。而與接受47WT CAR T與B6H12聯(lián)合治療相比,接受47E CART與B6H12聯(lián)合治療TME中的T細胞顯示出595個差異表達基因(DEG),包括增加的促炎基因集,如IL-12、CD40/CD40L和NF-κB信號傳導(dǎo)。這些數(shù)據(jù)為47E-CAR T細胞TME內(nèi)的髓細胞和T細胞之間的實質(zhì)性串擾提供了證據(jù)。

接下來評估47WT或47E T細胞加抗CD47治療在多種腫瘤模型中的抗腫瘤作用。在143B中,CAR T細胞和抗CD47療法作為單一療法的效果最小。用B6H12處理后,47WT CAR T細胞完全耗盡,而47E CAR T淋巴細胞持續(xù)數(shù)周。只有B6H12加47E-CART細胞誘導(dǎo)腫瘤生長的顯著延遲和總生存率的提高。在轉(zhuǎn)移性神經(jīng)母細胞瘤中,將B6H12與47WT和47E B7H3-BBζCAR T細胞配對,并觀察到47E CAR T淋巴細胞加B6H12增強了持久性和提高了抗腫瘤療效。在患有Nalm6-fLuc白血病的小鼠中,47E與47WT CD19-28ζCART細胞加B6H12增強了抗腫瘤功效。這些數(shù)據(jù)表明,CD47阻斷與表達47E的治療性T細胞配對可保護T細胞免受巨噬細胞介導(dǎo)的吞噬作用,并導(dǎo)致巨噬細胞在TME內(nèi)大量持續(xù)流入,這與T細胞-巨噬細胞的串擾有關(guān)。其結(jié)果是在實體、液體和轉(zhuǎn)移性腫瘤中具有強大的抗腫瘤協(xié)同作用。

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圖5 47ET 細胞療法加抗 CD47 治療通過招募不同的巨噬細胞群來增強抗腫瘤功效

小結(jié)
先前的研究報告稱,CD47是防止免疫排斥所必需的。CD47 過表達與 MHC 敲除相結(jié)合使CAR T 細胞對抗同種異體免疫排斥反應(yīng)。但是作者團隊研究結(jié)果表明,即使在沒有免疫排斥反應(yīng)的情況下,CD47也是過繼轉(zhuǎn)移T細胞存活所必需的,CD47過表達可提高CAR T細胞的存續(xù)和療效。NSG小鼠中的抗CD47處理誘導(dǎo)巨噬細胞介導(dǎo)的過繼轉(zhuǎn)移T細胞的快速和完全耗竭。其反應(yīng)足夠快速和有效,足以在致命的CAR T細胞毒性模型中介導(dǎo)完全保護,這可能具有立竿見影實現(xiàn)臨床受益。這些結(jié)果與數(shù)據(jù)一致,表明CD47敲除CAR T細胞在異種移植模型中被迅速清除,以及觀察到 Cd47 和 Sirpa 敲除小鼠的總淋巴細胞和抗原特異性淋巴細胞減少、感染易感性增加和自身免疫易感性降低。

盡管CD47阻斷大大增強了T細胞耗竭,但即使在沒有CD47-SIRPα阻斷的情況下,巨噬細胞吞噬作用也限制了過繼轉(zhuǎn)移的T細胞的持久性。臨床scRNA-seq數(shù)據(jù)也發(fā)現(xiàn)了髓系細胞內(nèi)的CAR mRNA。總之,這些發(fā)現(xiàn)與巨噬細胞吞噬作用在調(diào)節(jié)T細胞穩(wěn)態(tài)中起重要作用的模型一致。在長時間培養(yǎng)后,T細胞上“吃我”信號的表達增加,CD47的表達減少,提出了CD47-SIRPα軸可能類似地調(diào)節(jié)衰老T細胞清除率的前景。未來的研究需要更好地定義T細胞活化和分化、促吞噬和抗吞噬受體的表達以及吞噬作用敏感性之間的關(guān)系。

作者團隊觀察到CAR T細胞誘導(dǎo)巨噬細胞快速涌入腫瘤,巨噬細胞的持續(xù)募集取決于CAR T細胞的存續(xù)。結(jié)果,47ECAR T細胞受體在TME中表現(xiàn)出髓樣細胞和T細胞之間的廣泛串擾,包括T細胞中IL-12、CD40L和NF-κB信號傳導(dǎo)的誘導(dǎo)。因此,47E保護 T 細胞免受 CD47 介導(dǎo)的吞噬作用,同時增強腫瘤吞噬作用、抗原呈遞和誘導(dǎo)促炎性 TME。需要更多的研究來測試 47E在完全免疫功能正常的系統(tǒng)中,以了解對其他免疫細胞類型的影響,包括內(nèi)源性 T 細胞和自然殺傷細胞。雖然 B6H12 是一種研究級抗體,但本研究中產(chǎn)生的 CD47 變體也對抗了與臨床級抗體 TJC4(lemzoparlimab)的結(jié)合,這將預(yù)測 47E可以將過繼療法與臨床級抗 CD47 抗體配對。

參考文獻:
Sean A Yamada-Hunter, Johanna Theruvath, Brianna J McIntosh, et al. Engineered CD47 protects T cells for enhanced antitumour immunity. Nature. 2024 May 15.
https://www.nature.com/articles/s41586-024-07443-8

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