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單晶解析入門第4講:如何申請(qǐng)CCDC號(hào)和獲取CIF文件?
路漫學(xué)術(shù) 納米人 2018-10-30

本文來源:王峰峰,路漫學(xué)術(shù)單晶解析專欄顧問,小木蟲ID:lich666。


一、如何申請(qǐng)CCDC號(hào)?

 

CCDC是Cambridge Crystallographic Data Centre的簡(jiǎn)稱,即劍橋晶體數(shù)據(jù)中心。通過其網(wǎng)站(http://www.ccdc.cam.ac.uk/)可以上傳并儲(chǔ)存晶體信息文件(cif文件),方便審稿人和讀者查閱。該中心主要收載含碳的有機(jī)物和配合物,并將相應(yīng)數(shù)據(jù)打包做成CSD系統(tǒng)(Cambridge Structural Database)出售供科研工作者查找從而獲利。

 

1. 進(jìn)入CCDC網(wǎng)站后出現(xiàn)下圖頁面。 

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2. 點(diǎn)擊Deposit Structures后出現(xiàn)下圖登錄界面。 

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3. 如果不想登錄,點(diǎn)擊上圖中紅色箭頭處鏈接,就可以回到之前的不用登錄直接申請(qǐng)的界面了,如下圖所示: 

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4. 點(diǎn)擊右上角”國(guó)旗圖標(biāo)“,照中文提示申請(qǐng)。 

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5. 首先將姓名、郵箱、單位信息填入。如果未申請(qǐng)過CCDC號(hào),則CCDC號(hào)碼項(xiàng)留空;如果已經(jīng)申請(qǐng)過,則此項(xiàng)填入系統(tǒng)所給的CCDC號(hào)碼即可。

 

6. 點(diǎn)擊”加入文件“按鈕即可添加cif文件,點(diǎn)擊”提交您的cif文件“按鈕即可上傳cif文件并跳入下個(gè)步驟。按步驟依次進(jìn)行,并提交完相應(yīng)文件后會(huì)有一封郵件發(fā)至郵箱告知CCDC號(hào)。

 

CCDC號(hào)申請(qǐng)小貼士:

 

1)經(jīng)常有人提問,如果checkcif后有AB警告可以申請(qǐng)CCDC號(hào)么?

答案是可以。CCDC全稱為The CambridgeCrystallographic Data Centre,承擔(dān)了晶體學(xué)數(shù)據(jù)(主要是cif文件和fcf文件)儲(chǔ)存和交流的工作。該工作是無償?shù)模覍?duì)數(shù)據(jù)的重復(fù)性和準(zhǔn)確性不進(jìn)行調(diào)查。因此,晶體學(xué)數(shù)據(jù)檢查的重任就落到了作者本身和審稿人的身上。所以,CCDC號(hào)可以隨便申請(qǐng),結(jié)構(gòu)合不合理就得審稿人說的算。

2)還有人提問,如果我申請(qǐng)了CCDC號(hào),是不是以后有人做了重復(fù)的結(jié)構(gòu)就不能申請(qǐng)了呢?

答案還是可以申請(qǐng)。CCDC不對(duì)數(shù)據(jù)的重復(fù)性和準(zhǔn)確性進(jìn)行調(diào)查,而且還可以選擇不公開發(fā)表,所以一個(gè)結(jié)構(gòu)有多個(gè)號(hào)也不足為奇。想要申請(qǐng)個(gè)CCDC號(hào)占坑的同學(xué)們就死心了吧。

 

二、如何獲取CIF文件?

 

經(jīng)常有同學(xué)拿著文章中的CCDC號(hào)求助如何獲取相應(yīng)CIF文件。其實(shí)這個(gè)過程是免費(fèi)且快捷的。

 

1.首先在百度中搜索“CCDC”關(guān)鍵詞,會(huì)指向劍橋晶體數(shù)據(jù)中心(CCDC)的網(wǎng)站。點(diǎn)擊Access Structures,開始獲取cif文件。 

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2.點(diǎn)擊AccessStructures后彈出如下頁面。可以用如下三種方式獲取Cif文件。

CCDC numbers:由數(shù)字組成的CCDC編號(hào)。

Publication DOI:數(shù)字文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)符。

CSD refcode:由字母組成的CSD標(biāo)示符。

在這三個(gè)方框中任意一個(gè)輸入相應(yīng)信息后,點(diǎn)擊Submit即可。 

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3.提交后出現(xiàn)如下對(duì)話框,可以給出CSD entry名稱,CCDC編號(hào),結(jié)構(gòu)信息,文獻(xiàn)等。點(diǎn)擊Download按鈕即可下載相應(yīng)CIF文件。 

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4. 注意

(1)CCDC網(wǎng)站僅提供含碳有機(jī)物的查找和下載功能。無機(jī)物請(qǐng)查找ICSD數(shù)據(jù)庫,粉末衍射數(shù)據(jù)請(qǐng)查找PDF卡片。

(2)CCDC網(wǎng)站僅免費(fèi)提供由編號(hào)查找結(jié)構(gòu)功能,如果需要由結(jié)構(gòu)圖、化合物名稱等方式搜索,請(qǐng)購買其CSD數(shù)據(jù)庫。

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