許多肽衍生的天然產(chǎn)物是由非核糖體肽合成酶(NRPS)合成的,每個氨基酸通過兩個不同的反應(yīng)與指定的肽基載體蛋白(PCP)偶聯(lián),這兩個反應(yīng)依次由腺苷酸結(jié)構(gòu)域的單個活性位點催化。近日,普林斯頓大學(xué)Haw Yang、明斯特大學(xué)Henning D. Mootz報道了亞結(jié)構(gòu)域動力學(xué)使非核糖體肽合成酶發(fā)生化學(xué)鏈?zhǔn)椒磻?yīng)。
本文要點:
1) 作者使用單分子F?rster共振能量轉(zhuǎn)移表明合成酶的A結(jié)構(gòu)域在酶周期中具有結(jié)構(gòu)延伸和功能強(qiáng)制性構(gòu)象,并在腺苷化和硫酯形成結(jié)構(gòu)之間交替。作者采用生物化學(xué)、計算和小角度X射線散射研究揭示了這三種構(gòu)象之間的固有相互轉(zhuǎn)化。
2) 作者定量分析了結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)變和酶促轉(zhuǎn)化之間的緊密動力學(xué)耦合,并揭示了合成酶I A結(jié)構(gòu)域如何利用其固有的構(gòu)象動力學(xué)來驅(qū)動具有柔性連接的PCP結(jié)構(gòu)域的定向生物合成。
Xun Sun et.al Subdomain dynamics enable chemical chain reactions in non-ribosomal peptide synthetases Nature Chemistry 2023
DOI: 10.1038/s41557-023-01361-4
https://doi.org/10.1038/s41557-023-01361-4