轉(zhuǎn)錄是分子生物學(xué)中的一個(gè)關(guān)鍵過程,在RNA合成中有許多應(yīng)用,包括mRNA疫苗和RNA療法。然而,目前的RNA表征技術(shù)受到擴(kuò)增和酶偏見的影響,導(dǎo)致天然信息的丟失。
劍橋大學(xué)Ulrich Felix Keyser和Filip Bo?kovi?等介紹了一種通過利用RNA納米技術(shù)和納米孔對(duì)RNA進(jìn)行分級(jí)來定量研究轉(zhuǎn)錄和RNA聚合酶行為的策略。
本文要點(diǎn):
(1)
首先,作者利用T7 RNA聚合酶轉(zhuǎn)錄缺少終止序列的線性DNA。令人驚訝的是,作者在復(fù)制序列的起點(diǎn)發(fā)現(xiàn)了選擇性轉(zhuǎn)錄終止。接下來,作者使用沒有轉(zhuǎn)錄終止子的環(huán)狀DNA進(jìn)行滾環(huán)轉(zhuǎn)錄。這使作者能夠在單分子水平上深入了解RNA聚合酶的持續(xù)能力和轉(zhuǎn)錄行為。作者的工作展示了如何將RNA納米技術(shù)和納米孔串聯(lián)起來用于RNA轉(zhuǎn)錄本的直接定量分析。
(2)
這種方法通過在單分子水平上研究全長RNA轉(zhuǎn)錄本,為精確的RNA結(jié)構(gòu)作圖提供了一條有前途的途徑。
參考文獻(xiàn):
Pati?o-Guillén, G., Pe?ovi?, J., Pani?, M. et al. Single-molecule RNA sizing enables quantitative analysis of alternative transcription termination. Nat Commun 15, 1699 (2024).
DOI: 10.1038/s41467-024-45968-8
https://doi.org/10.1038/s41467-024-45968-8