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Nature Chem:活細胞的基因編輯色氨酸
納米技術 納米 2024-02-28

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色氨酸(Trp, Tryptophan)通過分子的π化學鍵結構和吲哚N-H官能團起到調節蛋白質結構、相互作用和功能方面的關鍵作用。通過發展一種具有普適性的阻斷和引發Trp相互作用的方法能夠在體內對各種含有Trp的蛋白質進行功能操作,但如何發展這種控制Trp相互作用的方法仍然具有非常大的挑戰。

有鑒于此,北京大學陳鵬樊新元、浙江大學林世賢報道開發了一種基因編碼的N1-乙烯基-結構Trp,能夠通過優化Diels–Alder反應電子需求的反向,從而實現快速和進行生物正交進行脫籠因此能夠特異性的將活細胞感興趣的蛋白質的Trp位點激活

本文要點

(1)

這種基因編碼的籠狀色氨酸(Trp-CAGE)策略具有的化學激活作用能夠精確的激活感興趣的Trp位點,這說明分子相互作用的重要作用。作者說明Trp-CAGE能夠作為翻譯起始物和翻譯后修飾讀取器用于各種蛋白質家族(比如過氧化氫酶過氧化物酶和激酶),并且能夠以時間控制的方式調節表觀遺傳信號。

(2)

通過與計算機輔助預測進行結合,這個策略能夠對天然細胞環境中28000多種蛋白質的Trp生物正交提供幫助。

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參考文獻

Zhu, Y., Ding, W., Chen, Y. et al. Genetically encoded bioorthogonal tryptophan decaging in living cells. Nat. Chem. (2024)

DOI: 10.1038/s41557-024-01463-7

https://www.nature.com/articles/s41557-024-01463-7

 


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