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Nature Chem:核苷酸增加DNA折疊結構的種類
納米技術 納米 2024-06-14

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向DNA加入合成核苷酸(synthetic nucleotides)能夠增加DNA分子包含的信息,有鑒于此,上海交通大學譚蔚泓院士、火鳥生物分子科學公司(Firebird Biomolecular Sciences LLC)Steven A. Benner、Zunyi Yang等報道對DNA加入合成核苷酸不僅能夠增加DNA分子的線性信息密度,而且能夠增加構成的三維折疊結構種類。

本文要點

(1)

當在長度為23個核苷酸長度的DNA分子鏈的12個位點上安裝核苷酸dZ(具有5-硝基-6-氨基吡啶酮的核酸堿基),能夠形成非常穩定的分子結構,這種分子結構在pH 8.5和66.5 ℃發生溶解。

(2)

通過光譜表征、凝膠分析、2D NMR表征發現Z型折疊結構存在6個可逆的dZ-:dZ堿基對。熒光標記結果發現dZ-:dZ堿基對能夠形成四個緊密平行折疊的結構。這種折疊有可能形成兩種可能的結構:一種是插嵌的dZ-:dZ,另一種沒有插嵌。插嵌的結構能夠在pH≤6.5形成dC:dC+,這種fZ結構有助于DNA形成緊湊的結構。

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參考文獻

Wang, B., Rocca, J.R., Hoshika, S. et al. A folding motif formed with an expanded genetic alphabet. Nat. Chem. (2024).

DOI: 10.1038/s41557-024-01552-7

https://www.nature.com/articles/s41557-024-01552-7

 

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