原位冷凍電子斷層掃描能夠研究大分子在其天然細胞環(huán)境中的情況。由于最近的軟件和硬件進步,樣品變得更加容易獲得。然而,數(shù)據(jù)收集仍然需要經(jīng)驗豐富的操作員和可觀的顯微鏡時間來仔細選擇高通量傾斜系列采集的目標。鑒于此,來自日本東京大學的Radostin Danev等人開發(fā)了智能并行自動冷凍電子斷層掃描(SPACEtomo)。
文章要點:
1) 該研究開發(fā)的這種方法是一種使用機器學習方法的工作流程,可以完全自動化整個冷凍電子斷層成像過程;
2) 該研究發(fā)現(xiàn),這中方法實現(xiàn)的自動化過程可以含括薄片檢測、生物特征分割、目標選擇和并行傾斜序列采集,并且,所有這些都不需要人為干預(yù),這種自動化程度對于在天然環(huán)境中獲得統(tǒng)計相關(guān)的數(shù)據(jù)集和大分子的高分辨率結(jié)構(gòu)至關(guān)重要。
參考資料:
Eisenstein, F., Fukuda, Y. & Danev, R. Smart parallel automated cryo-electron tomography. Nat Methods (2024).
10.1038/s41592-024-02373-9
https://doi.org/10.1038/s41592-024-02373-9