蛋白質相互作用（PPIs）調節信號通路和細胞表型，因此PPIs空間分辨動力學的可視化將揭示信號網絡的激活和串擾。于此，佐治亞理工學院和埃默里大學Ahmet F. Coskun等人報告了一種方法，該方法利用順序鄰近連接分析法對PPI進行多重分析，其中多達47種蛋白質參與多信號串擾通路。
研究人員該方法應用于具有突變表皮生長因子受體的非小細胞肺癌的細胞培養和組織，然后進行常規免疫熒光，以確定PPI在亞細胞體積中的共定位，并重建PPI在酪氨酸激酶抑制劑osimertinib干擾下的亞細胞分布變化。研究還表明，編碼空間分辨PPI的圖卷積網絡可以準確預測單個細胞的細胞處理狀態。基于圖的深度學習輔助的多重鄰近連接分析可以深入了解PPI的亞細胞組織，從而設計靶向蛋白質相互作用組的藥物。
參考文獻：
Cai, S., Hu, T., Venkataraman, A. et al. Spatially resolved subcellular protein–protein interactomics in drug-perturbed lung-cancer cultures and tissues. Nat. Biomed. Eng (2024).
https://doi.org/10.1038/s41551-024-01271-x
